Jenkins a murit din cauze necunoscute în Japonia, unde locuia împreună cu soţia sa, Hitomi Soga, o femeie japoneză răpită de agenţii regimului de la Phenian în anii '70, şi cele două fiice ale cuplului, născute în Coreea de Nord.

Regimul de la Phenian i-a permis lui Jenkins şi familiei lui să părăsească ţara.

Jenkins s-a predat autorităţilor militare americane în anul 2004, când a ajuns în Japonia.

În faţa Curţii Marţiale, Jenkins a spus că a dezertat de la postul său din Zona Demilitarizată între cele două Corei, pe data de 5 ianuarie 1965, pentru a evita transferul în Vietnam, acolo unde trupele americane luptau împotriva forţelor armate nord-vietnameze şi gherilelor comuniste.

Găsit vinovat de dezertare şi ajutarea inamicului, Jenkins a executat o sentinţă de 30 de zile de închisoare.