Viceministrul Tansporturilor Sergiu Bucataru a precizat că fondarea Agenţiei navale este necesară ca urmare a implementării prevederilor Acordului de Asociere cu UE şi reformelor pentru ieşirea Republicii Moldova din „lista neagră” a Memorandumului de la Paris.

Instituţia se va afla la autofinanţare, iar principala sursă de venit va fi înregistrarea navelor. Inscrierea navelor în Registru se va face doar cu avizul Ministerului Afacerilor Externe şi Integrării Europene, ceea ce va împiedica înscrierea navelor cu trecut dubios sub pavilionul Republicii Moldova.

Fiecare navă va trebuie să fie verificată tehnic în statul în care este înregistrată cel puţin o dată pe an. În caz contrar, nava va fi radiată din listă, iar navele ce nu vor fi înregistrate de autoritatea naţională nu vor mai reveni în apele Republicii Moldova.